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DNA Bank Network - Help - Input Mask
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Übersicht >> Dateneingabe

Dateneingabe:

Mit diesem Formular können Sie DNA-Daten eingeben und dem richtigen Beleg zuordnen.
Die Eingabe-Maske ist aufgeteilt in Specimen-relevante Daten (grün) und DNA-relevante Daten (schwarz).
Als erstes sollten Sie die Specimen-/bzw. Aufsammlungs-Daten abrufen.
 
Grafik 2

 
Übersicht >> Dateneingabe >> DNA-Daten

DNA-Daten eingeben

Last DNA No:

 Die DNA-Nummern sind aufsteigend sortiert. Hier wird die höchste vergebene und eingetragene Nummer angezeigt. Das entspricht meist, jedoch nicht immer der zuletzt eingegeben DNA-Nummer.

DNA Extraction Number:

 Pflichtfeld. Das Format sollte immer eine Zahl sein. Sollten Sie für die spätere Darstellung im Webportal einen Institutions-Code davorsetzen wollen, kann das später für alle Datensätze festgelegt werden.

Relation to Voucher:

 Pflichtfeld. Erweiterbar. Hier ist folgende Auswahl möglich:
- DNA from specimen (voucher)
- DNA and specimen from the same population
- DNA from cultivated offspring of the specimen
- No voucher available (voucher->observation) -> das trifft z.B. zu, wenn im Feld nur eine Feder, Blut oder ein Blatt entnommen wurden und nicht das Individuum als Ganzes entnommen wird. Im Idealfall sollte dann dazu ein Foto vom Naturstandort existieren

Tissue:

 Erweiterbar. Bezeichnet das Gewebe bzw. Organ, von dem DNA entnommen wurde (z.B. Muskel, Blüte).

Preservation:

 Erweiterbar. Bezeichnet die Konservierungsmethode des Gewebes/Individuums, aus dem DNA entnommen wurde. (z.B. Alkohol, Frischmaterial, Silikagel)

DNA Type:

 Auswahl zwischen "Complete DNA" und "Mitochondrial DNA" möglich.

DNA Extraktion Method:

 Pflichtfeld. Erweiterbar. Bezeichnet das Extraktionskit.

DNA Extraction Date:

 Pflichtfeld. Bezeichnet das Datum der Extraktion. Das Format ist vorgegeben.

DNA Extraktion Staff:

 Pflichtfeld. Erweiterbar. Anzeige nur intern, nicht im Webportal. Bezeichnet den, der die Extraktion durchgeführt hat.

DNA Purification Method:

 Pflichtfeld. Erweiterbar. Bezeichnet das Aufreinigungskit.

Ratio of absorbance:

 Bezeichnet die Werte der optischen Dichte. Zugelassen sind die Ziffern 0-9 sowie der Punkt.

DNA Concentration:

 Bezeichnet den Wert der Konzentration. Zugelassen sind die Ziffern 0-9 sowie der Punkt.

DNA Quality:

 Auswahl zwischen "high", "medium" und "low".

DNA Qualtity Check Date:

 Bezeichnet das Datum der Qualitätsmessung (Messung von Konzentration und optischer Dichte).

Number of Aliquots:

 Anzeige nur intern, nicht im Webportal. Anzahl der hergestellten Aliquots, Standardwert ist in diesem Beispiel "5". Dabei ist zu beachten, dass der Stock extra gewertet wird. Also wenn man 5 eingibt, bedeutet das, dass 5 Aliquots plus 1 Stock angelegt und gespeichert werden.

µl per Aliquot:

 Anzeige nur intern, nicht im Webportal. Volumenangabe pro Aliquot. Beim Speichern wird im Hintergrund das Gesamtvolumen aller zusammengehörenden Aliquots berechnet sowie die Aliquot-Nummer vergeben.
z.B. DNA-Nummer: 1234, fünf Aliquots angelegt
-> 1. Aliquot: 1234-A
-> 2. Aliquot: 1234-B
-> 3. Aliquot: 1234-C
-> 4. Aliquot: 1234-D
-> 5. Aliquot: 1234-E

Location Stock Solution:

 Pflichtfeld. Anzeige nur intern, nicht im Webportal. Bezeichnet den Lagerort des Stock. Dahinter kann man die Menge des Stocks in µl eintragen. Der Standardwert in diesem Beispiel liegt bei "47".

Location Aliquots:

 Kein Pflichtfeld, jedoch erscheint bei Nichtangabe eine Meldung. Anzeige nur intern, nicht im Webportal. Bezeichnet den Lagerort der Aliquots. Normalerweise passen mehrere Aliquots in eine Box, so dass nur einmal für alle zusammengehörenden Aliquots der Lagerort eingetragen werden muss. Es kann jedoch sein, dass zusammengehörende Aliquots sich auf mehrere Boxen verteilen oder unterschiedliche Volumina aufweisen. Für diesen Fall kann man die in Grafik 3 markierte Box aktivieren und es erscheint eine weitere Tabelle mit der Möglichkeit zur Eingabe von 10 verschiedenen Aliquots. Gleichzeitig verschwinden die Eingabemöglichkeiten für "Number of Aliquots", "µl per Aliquot" sowie "Location Aliquots" (siehe Grafik 4). Hierbei muss nun für JEDES angelegte Aliquot der Lagerort und die µl festgelegt werden. Sollten Sie mehr als 10 Aliquots anlegen wollen, können sie über die Suchfunktion den Datensatz suchen und weitere Aliquots hinzufügen.

Grafik 3

Grafik 4

Backup Aliquot:

 Anzeige nur intern, nicht im Webportal. Diese Box ist standardmäßig markiert. Es bezeichnet das Aliquot, was zur Sicherheit zusätzlich angelegt wird. Es bekommt keinen fortlaufenden Buchstabenzusatz wie die normalen Aliquots.

Source material gone:

 Anzeige nur intern, nicht im Webportal. Als Ausgangsmaterial ist hier z.B. die Silikaprobe, allgemein die Gewebeprobe oder der ganze Beleg gemeint.

DNA Sample Provided by:

 Erweiterbar. Anzeige nur intern, nicht im Webportal. Bezeichnet den externen Wissenschaftler, der die DNA zur Verfügung gestellt hat.

Block until:

 Sofern der externe Wissenschaftler (DNA Sample Provided by) die Weitergabe des DNA-Materials bis zu einem bestimmten Zeitpunkt blocken möchte, kann hier das jeweilige Datum eingetragen werden. Das Format ist vorgegeben.
Die DNA wäre dann im Webportal suchbar, jedoch nicht bestellbar!

Block in General:

 Sofern die DNA-Probe aus z.B. artenschutzrechtlichen Gründen nicht weitergegeben werden darf, muss diese Box markiert sein.
Die DNA wäre dann im Webportal nicht suchbar und auch nicht bestellbar!

Notes:

 Anmerkungen zu dieser DNA-Probe.

Amplification:

 Wenn Amplifikationen durchgeführt wurden, muss diese Box (Grafik 5) markiert werden. Dann öffnet sich eine weitere Tabelle (Grafik 6).

Grafik 5

Grafik 6

Amplification successful:

 Auswahl ja oder nein.

Amplification Date:

 Bezeichnet das Datum der Amplifikation. Das Format ist vorgegeben.

Staff:

 Bezeichnet den, der die Amplifikation durchgeführt hat.

Fragment:

 Erweiterbar. Bezeichnet das Fragment an dem die Amplifikation durchgeführt wurde.

GenBank Acc.No:

 Sofern vorhanden, kann hier die Gen Bank Accession Number eingetragen werden.

Link:

 Sofern eine Gen Bank Accession Number vorhanden ist, kann hier der entsprechende Link eingetragen werden

add more Amplifications:

 Beim Markieren dieser Box öffnet sich die gleiche Tabelle für vier weitere Eintragungen.